Nome: Giratina
Numero: 487
Tipo: Spettro/Drago
Descrizione: all'alba dei tempi Giratina fu bandito per la sua violenza e fu relegato nel Mondo Inverso, una dimensione parallela esattamente opposta a quella in cui viviamo di cui è il signore incontrastato. Giratina è inoltre l'unico Pokémon ad avere il potere di viaggiare fra i due mondi: Giratina sfrutterà questa capacità per dare la caccia a Dialga, responsabile insieme a Palkia di aver inquinato la sua dimensione. I suoi poteri lo renderanno però preda di un pericoloso nemico...
Capacità: trasformazione (Forma Originale e Forma Alterata), viaggio fra dimensioni, controllo del Mondo Inverso

Nome: Shaymin
Numero: 492
Tipo: Erba - Erba/Volante
Descrizione: Shaymin è un piccolo Pokémon che incarna i sentimenti di gratitudine delle persone, tanto che nella regione di Sinnoh si usa regalare un bouquet di fiori di Gracidea (simili al mostriciattolo) come segno di ringraziamento. Ogni anno decine di Shaymin si riuniscono per dare vita a un magnifico giardino di fiori di Gracidea.
Capacità: comunicazione telepatica, trasformazione (Forma Terra e Forma Cielo), purificazione dell'aria, apertura di varchi d'uscita dal Mondo Inverso, originazione fiori

Nome: Dialga
Numero: 483
Tipo: Acciaio/Drago
Descrizione: già comparso nel film precedente, Dialga fa una breve comparsa all'inizio di questo film. Il leggendario Pokémon che governa la dimensione temporale è impegnato in una lotta senza esclusione di colpi con Palkia, suo nemico naturale. Questo scontro ha però causato una serie di sconvolgimenti nel Mondo Inverso, rendendolo l'obiettivo della furia di Giratina...
Capacità: viaggio fra dimensioni, controllo del flusso temporale, creazione di bolle temporali

Nome: Regigigas
Numero: 486
Tipo: Normale
Descrizione: si narra che questo colossale Pokémon abbia trainato i continenti durante la formazione del nostro mondo, per poi ritirarsi all'interno del suo tempio. Ma in caso di eventi catastrofici, Regigigas è sempre pronto ad intervenire...
Capacità: forza smisurata